O programa de pós-graduação em Cardiologia na Escola Paulista de Medicina da Universidade Federal de São Paulo teve início em 1978. De lá, até o final de 2016 foram defendidas 174 teses de mestrado e 182 de doutorado, além de publicado centenas de artigos completos em periódicos nacionais e internacionais.
Neste período, vários orientadores desempenharam suas funções de forma brilhante e vários alunos graduados, com mestrado ou doutorado, atuam nesta ou em outras Instituições de Ensino Superior no Brasil onde formaram novos núcleos de pesquisas, além de exercerem atividades assistenciais e de ensino na área médica ou biológica. Vários setores desenvolvem cursos e atividades de estudo na forma de seminários apresentados pelos alunos, sob a supervisão de um coordenador ou de egressos do programa que atuam em alguns setores, muitas vezes de forma voluntária, demonstrando o vínculo estabelecido entre o aluno e o grupo com o qual conviveu.
A base do programa é a relação estreita entre o orientador e o orientando que devem atuar de forma integrada desde a elaboração e desenvolvimento do projeto de estudo até a publicação final. O programa estimula também a integração entre os alunos, linhas de pesquisas do programa em cardiologia e de outros programas desta e de outras universidades como demonstrado em algumas teses ou publicações. Os setores estão devidamente organizados. Foram criadas novas disciplinas do programa que se desenvolvem semanalmente durante todo o ano, sob a coordenação de cada setor responsável. Os alunos de diferentes setores podem cursar e obter créditos e conhecerem outras linhas de pesquisa de modo a interagir com os demais. Os orientadores e alunos são continuamente estimulados a inovar e a trilhar novos caminhos dentro das diferentes linhas de pesquisa e a procurarem por financiamento dos projetos, o que tem sido conseguido.
O programa conta atualmente com 22 orientadores credenciados, 17 permanentes e 05 colaboradores; além do doutorado, 08 tem mestrado, 12 pós-doutorado e 14 são livre-docentes. Os orientadores estimulam os alunos para a produção científica inédita e independente. Nos últimos anos a maioria dos produtos das teses tem sido publicada em periódicos indexados. Podem ser alunos do Programa de Pós-Graduação em Cardiologia da Escola Paulista de Medicina, profissionais médicos e de diferentes áreas da saúde com potencial de atuação em cardiologia. Profissionais de outras áreas além das da saúde podem também se inscrever desde que haja interesse do programa ou de orientadores para desenvolver determinados tipos de projetos de pesquisa.