A história do Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde Aplicadas à Reumatologia se funde com a história da formação da Disciplina de Reumatologia na Escola Paulista de Medicina.
Chamado inicialmente de Setor de Reumatologia, o mesmo foi fundado em 1974 pelo Prof. Edgard Atra e em 1978 foi criada a Disciplina de Reumatologia, ligada ao Departamento de Medicina. O Programa de Pós-Graduação em Reumatologia foi criado em 1983. O Programa de Pós-Graduação, na sua modalidade Strictu Sensu, possui cursos de mestrado e doutorado, além de alunos de pós-doutorado. Tem por objetivo a formação de recursos humanos, qualificados técnica e cientificamente para o exercício das atividades de ensino e de pesquisa, principalmente nas áreas de imunologia básica e aplicada à reumatologia, aspectos clínicos e epidemiológicos das doenças reumáticas, fisioterapia e reabilitação, doenças osteometabólicas e terapêutica. São admitidos no Curso de Pós-Graduação além de médicos reumatologistas e especialistas em outras áreas, profissionais de nível superior de diversas áreas do conhecimento com interesse em estudos na área da saúde aplicada à reumatologia, como fisioterapia, terapia ocupacional, biologia, biomedicina, odontologia, psicologia, educação física e nutrição, entre outras.