O Programa de Pós-graduação em Saúde Coletiva recebe apoio financeiro da CAPES – Verba PROAP. Outras agências de fomento têm sido essenciais para o programa, tais como: FAPESP, CNPq, FINEP, CAPES, FUNAD (Fundo Nacional Antidrogas), Ministério da Saúde, United Nations on Drugs and Crime, Columbia University.