Docente (s) Responsável (s)
Augusto Coppi (University of Bristol, Reino Unido)
Ricardo M. Arida
Ementa
OBJETIVOS 1. Compreender e aplicar os métodos inovadores de análise quantitativa de imagens em 3D no contexto da investigação médica, biomédica e veterinária. 2. Introduzir o conceito de Inteligência Artificial (IA) e suas aplicações à análise quantitativa de imagens em 3D. 3. Oferecer assistência tutorial individualizada a estudantes de pós-graduação e acadêmicos que pretendam utilizar esta metodologia inovadora em seus projetos de pesquisa.
JUSTIFICATIVA A pesquisa em morfologia quantitativa adquiriu recentemente um grau de complexidade diretamente proporcional ao progresso tecnológico em diversos campos do conhecimento incluindo biologia celular e molecular, anatomia, histopatologia e diagnostico por imagem. Dessa forma, a produção científica de qualidade precisa se ajustar às linhas e politicas editoriais de periódicos de circulação internacional com arbitragem e de alto fator de impacto, requerendo cada vez mais o conhecimento e a aplicação dos métodos de analise de imagem em 3D para monitorar de forma objetiva os processos biológicos investigados.
Conteúdo Programático
CONTEUDO 1. Introdução à Estereologia. 2.Morfometria vs Estereologia. 3. Amostragem Aleatória Uniforme Sistemática (SURS). 4. Estimadores de tamanho: Volume global. 5. Estimadores de tamanho: Princípio de Cavalieri. 6. Estimadores de tamanho: Volume local. 7. Estimadores de tamanho: Método Nucleator. 8. Estimadores de tamanho: Método Rotator. 9. Estimadores de tamanho: Densidade de Superfície. 10. Estimadores de número: O Método Disector. 11. Estimadores de número: Disetor Físico. 12. Estimadores de número: Disetor Óptico. 13. Estimadores de número: Fracionador Físico. 14. Estimadores de número: Fracionador Óptico. 15. Delineamento Experimental e Estatística para Análise Quantitativa de Imagens em 3D. 16. Uso da Inteligência Artificial para Análise Quantitativa de Imagens em 3D. 17. Estudos de caso usando projetos de pesquisa conduzidos pelos participantes e assistência individual para os participantes. FORMA DE AVALIAÇÂO Presença: os alunos devem ter uma frequência obrigatória mínima de 75%. Nota: as notas serão atribuídas com base no desempenho nos seminários.
Período
09/01/2023 a 20/01/2023
Programa
This workshop will be delivered from 9th January to 20th January 2023 from 1pm to 5pm at UNIFESP in Sao Paulo (Brazil). Lectures and students’ seminars will happen on Mondays, Wednesdays and Fridays, while on Tuesdays and Thursdays there will be tutorials (by appointment) with students to assist their research projects.
Day 1 Monday 9th January 2023
Topic 1 (1-2pm) Introduction to 3D Image Analysis
Topic 2 (2-3pm) Morphometry vs Stereology
Topic 3 (3.30-5pm) Overview of Statistics applied to 3D Quantitative Image Analysis
Day 2 Tuesday 10th January 2023
Students’ tutorial (by appointment) 1-5pm
Day 3 Wednesday 11th January 2023
Topic 1 (1-2pm) Systematic Sampling in Experimental Design (SURS)
Topic 2 (2-3pm) Tissue preparation: fixation
Topic 3 (3.30-5pm) Tissue preparation: basics principles staining and of immunohistochemistry (IHC).
Day 4 Thursday 12th January 2023
Students’ tutorial (by appointment) 1-5pm
Day 5 Friday 13th January 2023
Topic 1 (1-2pm) Introduction to Design-Based Stereology
Topic 2 (2-3pm) Estimation of Global volume
Topic 3 (3.30-5pm) Estimation of Cell Number 1
Day 6 Monday 16th January 2023
Topic 1 (1-2pm) Estimation of Cell Number 2
Topic 2 (2-3pm) Estimation of Surface Area
Topic 3 (3.30-5pm) Estimation of Total Length
Day 7 Tuesday 17th January 2023
Students’ tutorial (by appointment) 1-5pm
Day 8 Wednesday 18th January 2023
Topic 1 (1-2pm) Estimation of Local Volume1
Topic 2 (2-3pm) Estimation of Local Volume 2
Topic 3 (3.15-4pm) Confocal Microscopy Stereology
Topic 4 (4-5pm) Diagnostic Imaging and Stereology
Day 9 Thursday 19th January 2023
Topic 1 (1-2pm) Digital Imaging and Image Analysis
Topic 2 (2-3pm) Computed-assisted 3D Image Analysis
Topic 3 (3.30-5pm) Artificial Intelligence for Quantitative 3D Image Analysis
Day 10 Friday 20th January 2023
Topic 1 (1-2pm) Designing a 3D Quantitative Image Analysis Study
Topic 2 (2-3pm) Students seminar 1
Topic 3 (3.15-4.30pm) Students seminar 2
Topic 4 (4.30pm-5pm) Workshop Wrap Up and Conclusion
Público-alvo
Pós-graduandos do Programa de Neurologia/Neurociências;
Pós-graduandos de outros programas, dependendo de disponibilidade de vagas.
Vagas
30
Carga Horária
50 horas
Quantidade de Créditos
3
Inscrições
de 12/12/2022 a 06/01/2023
Pelo Sistema de Notas da Pós-Graduação
siiu.unifesp.br
Forma de Avaliação
Presença: os alunos devem ter uma frequência obrigatória mínima de 75%.
Nota: as notas serão atribuídas com base no desempenho nos seminários.
Local
Ed. Octávio de Carvalho, sala 153, 1o. andar
Informações:
Email: Este endereço de email está sendo protegido de spambots. Você precisa do JavaScript ativado para vê-lo.