O ingresso nos cursos do Programa de Pós-Graduação em Otorrinolaringologia é contínuo ao longo do ano letivo.

O candidato deverá possuir linha de pesquisa própria e já desenvolver o seu trabalho junto com os docentes e pós-graduandos do programa. O aceite ocorrerá após avaliação do Projeto de Pesquisa que será desenvolvido durante o Pós Doutorado pelo Comitê de Ética e pelo  docente quer será o supervisor.

A atividade na iniciação científica por ser extracurricular é embasada nos projetos que são realizados em conjunto com a pós-graduação que vem sendo estimulada há mais de 10 anos quando foi criada a liga acadêmica de otorrinolaringologia com o acompanhamento desses alunos a partir do 2º ano até o 5º ano quando iniciam o internato. Todo ano é ministrado um curso de introdução acadêmica em otorrinolaringologia para os alunos interessados. Esse curso tem três dias de duração sendo no final realizada uma prova seletiva e os alunos selecionados participam durante o ano de atividades com tutoria de um dos docentes desse Programa.  

A maioria de nossos alunos de iniciação científica desenvolvem seus projetos com a participação do docente e em conjunto com um mestrando e/ou doutorando.  Os alunos bolsistas do CNPq ou mesmo da instituição (UNIFESP) iniciam as bolsas em agosto e terminam em junho do ano seguinte e muitos renovam suas bolsas por mais de um ano. 

A participação nessas atividades extracurriculares de iniciação científica tem também estimulado esses alunos a participar do intercâmbio internacional