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O ingresso no pós-doutorado em Saúde Coletiva ocorre em fluxo contínuo, para detentores do título de doutor. O candidato deve submeter um projeto de pesquisa, um plano de trabalho para 24 meses, prevendo a produção de artigos científicos, e a ementa de uma disciplina a ser ministrada no PPGSC, sob supervisão de seu supervisor. O supervisor deve ser escolhido entre os orientadores o programa, de acordo com a linha de pesquisa de interesse do candidato.